Sekisuiin adalah satu-satunya bangunan yang masih berdiri di Kuil Kosanji sejak zaman pengasas Myoe (1173-1232). Salah satu contoh peninggalannya adalah senibina gaya shinden-zukuri iaitu salah satu gaya senibina untuk rumah bangsawan pada zaman Kamakura (1185-1333).
Myoe
Myoe dilahirkan pada tahun ke-3 zaman Jōan (1173) di Yuasa (sekarang bandar Aridagawa, wilayah Wakayama). Penghidup kembali mazhab Kegon. Diajak menjadi sami oleh Sami Mongaku dari Kuil Jingoji. Belajar mengenai mazhab Kegon di Kuil Todaiji dan ajaran esoterik Buddha dari Kounen (sami mazhab Shingon) di Kuil Kajuji. Pada tahun pertama zaman Ken-ei (1206), dia dianugerahkan tanah di Toganoo dari Kuil Toba, lantas membina Kuil Kosanji sebagai pusat mazhab Kegon. Beliau meninggal dunia pada tahun ke-4 zaman Kangi (1232).
zaman Kamakura
Zaman selama lebih kurang 150 tahun, bermula dari pembukaan shogun di Kamakura oleh Minamoto no Yoritomo sehingga kemusnahan Hojo Takato pada tahun 1333 (tahun ke-3 zaman Genko).
shinden-zukuri
Bentuk perumahan bangsawan pada zaman Heian
Berhampiran pintu barat, terdapat satu patung kayu kecil Zenzaidouji (bahasa sanskrit: Sudhana). Myoe menyukai kisah perjalanan mencari kebenaran oleh Sudhana. Patung ini adalah sama dengan imej Sudhana yang Myoe miliki di kediamannnya sendiri.
Zenzaidouji
Seorang kanak-kanak yang muncul dalam Kitab Kegon, dan digambarkan sebagai calon ideal Bodhisattva. Dikatakan bahawa Sami Myoe mengagumi ketaatannya dan meletakkan patung Zenzaidouji di kediamannya. Patung sekarang ini diukir oleh Koku Nishimura pada awal zaman Showa.
Di bahagian selatan Sekisuiin tersimpannya titah maharaja mengenai pembangunan kuil, termasuk keratan dari kitab Kegon yang menjadi inspirasi nama Kuil Kosanji. Pemandangan Gunung Mukai dan Sungai Kiyotaki di bahagian selatan dibingkaikan dengan tiang kayu dan penutup kekisi.
Sungai Kiyotaki
Anak sungai kepada sungai Katsura dalam sistem Sungai Yodogawa, mengalir melalui daerah Kita dan Ukyo di Bandar Kyoto.
Gunung Mukai
titah maharaja
Titah yang ditulis oleh maharaja
Sekisuiin pada mulanya dibina untuk menyimpan kitab dan terletak di sebelah timur dewan utama Kuil Kosanji - juga dikenali sebagai Kondo. Bangunan asalnya termusnah akibat banjir pada tahun 1228, tetapi dibina semula menggunakan kediaman yang sedia ada di sekitar balairung seri. Selepas pembinaan semula, Sekisuiin mengabadikan Kasuga Daimyojin dan Sumiyoshi Myojin iaitu dewa Shinto yang sangat penting bagi Myoe. Pada waktu itu, Shinto dan Buddhisme dianggap berkait, dan dewa Shinto sering ditafsirkan sebagai penjelmaan dewa-dewa Buddha.
Kondo
Kuil yang menempatkan imej Buddha utama. Dikatakan nama ini diberikan kerana bahagian dalamnya yang berwarna emas. Merupakan pusat kuil dan dewan utama.
Kasuga Daimyojin
Sumiyoshi Myojin
Pada tahun 1889, Sekisuiin dipindahkan ke lokasi sekarang.