세키수이인은, 카이소우 묘에 (1173~1232년) 시대부터 코우산지에 남아있는 유일한 건물이다. 그러한 단층 신덴쓰쿠리는 가마쿠라 시대 (1185~1333년) 건축의 대표적인 것이다. 서쪽 출구 근처에는, 보살로 있는 선재동자 (산스크리트어:Sudhana) 의 작은 목상이 있다. 묘에는, 선재동자의 깨달음을 얻기까지의 여행 이야기를 사랑했다. 이 동상은 묘에 자신의 거주지에 두었다고 여겨지는 형상을 재현한 것이다. 세키수이인의 남쪽에는, 코우산지 명칭의 유래가 된 화태장경의 한 절을 포함, 사원의 창건을 명한 칙액이 걸려있다. 남측의 무코야마와 키요다키강 전망은, 목제 기둥과 격자 덧문으로 둘러 싸여있다. 세키수이인은 원래 경문을 보관하기 위해 만들어진 것으로, 코우산지 본당· 금당의 동쪽에 위치하고 있었다. 1228년의 홍수로 당초의 건물은 파괴되었지만, 예전의 조정의 부지 내에 있던 주거를 사용 후 재건되었다. 재건 후 세키수이인은, 묘에에게 있어서 특히 중요한 신도의 신이었던 카스가다이묘진·스미요시 묘진이 모셔져 있다. 당시, 신도와 불교는 완만하게 통합되어졌으며, 신도의 신들은 불교 신들의 화신으로 해석되어지는 경우가 많았다.

1889년 세키수이인은 현재의 장소로 이축되었다.